Introdução à Sequência Alinhamento

alinhamento de sequência é um método de comparar duas ou mais cadeias de proteínas , tais como Dan ou RNA . Ao fazer isso, pontos em comum pode ser encontrado que ajudar a esclarecer como um fio especial evoluiu. Existem três tipos principais de alinhamento de sequências : alinhamento pairwise , de alinhamento de sequências múltiplas e alinhamento estrutural. Semelhanças

alinhamento de sequências procura sobreposição cadeias elemento em dois ou mais filamentos de proteínas . Quanto mais sobreposições existem , o mais provável é que os fios têm algum tipo de relacionamento. Isso é útil para determinar as relações evolutivas entre os organismos .

Aplicações Biomédicas

alinhamento de sequências também serve um papel importante no desenvolvimento de novos medicamentos e vacinas . Ao identificar o fio de um vírus , os cientistas são mais capazes de desenvolver remédios para combatê-la.

Pairwise Sequence Alignment

Um alinhamento pairwise compara as correntes que se sobrepõem de elementos em duas cadeias de proteínas . Os fios são escritas com uma em cima da outra , e as cadeias comuns são identificados .

Alinhamento múltiplo de sequências

Um alinhamento de múltiplas sequências é semelhante a uma sequência de dois a dois alinhamento , mas isso é feito com mais do que dois cordões . A quantidade de cadeias elementares sobrepostas é menor porque há mais vertentes. Um alinhamento de sequências múltiplas às vezes pode aparecer em forma de árvore -forma.

Estrutural Alinhamento

Ao contrário de um alinhamento pairwise ou um alinhamento de sequências , um alinhamento estrutural examina a totalidade do dois ou mais filamentos de proteínas e não olha para cadeias elementares individuais. Alinhamentos estruturais não podem ser escritos , mas em vez disso deve ser examinado em três dimensões .