Tipos de Sequence Alignment
Um alinhamento de sequências é um método em bioinformática que é utilizado para analisar cadeias de proteína ( tal como ADN ou ARN ) e para determinar em comum entre os fios analisados . A seqüência de elementos em cada disciplina são normalmente alinhados em uma matriz , a fim de ver melhor onde há sobreposições. Os tipos mais comuns de alinhamento de sequências são alinhamento par a par , o alinhamento de sequências múltiplas e estrutural alignment.Pairwise Alinhamento
Um par de alinhamentos é feito com duas sequências . Uma seqüência é escrito sobre o outro e , em seguida, as cadeias de elementos que se sobrepõem são anotados. Existem cadeias repetidas de elementos em uma seqüência , porque eles eram uma adaptação evolutiva favorável. Nem todas as correntes têm o mesmo comprimento e, assim, lacunas e inserções deve ser observado no alinhamento pairwise .
Multiple Alignment Sequence
Um alinhamento múltiplo da seqüência é semelhante ao pairwise alinhamento , mas ele usa mais de duas seqüências de proteínas . Um alinhamento de sequências múltiplas , por vezes, podem ser apresentados de forma árvore -forma.
Estrutural Alinhamento
Um alinhamento estrutural é um tipo de alinhamento de sequências que compara o forma de duas ou mais sequências de proteínas . Ao contrário de alinhamento aos pares e de alinhamento de sequências múltiplas ( ambos os quais são só relacionada com os elementos dentro das sequências ) , um alinhamento estrutural olha para a totalidade das sequências como uma unidade individual . Alinhamentos estruturais não são escritos , mas devem ser comparados de forma tridimensional .
